Департамент организационно-имиджевой работы и протокола
Директор Департамента: Мухамедкали Салтанат
Департамента по продвижению межконфессионального и межцивилизационного диалога
Осуществление анализа состояния и динамики развития религиозной ситуации в мире.
Директор Департамента: Калилаханова Карлыгаш Танирбергеновна
Департамент религиоведческих исследований
Изучение основных направлений государственной политики, стратегических и программных документов в сфере религиозной деятельности и межконфессионального согласия в Республике Казахстан.
Директор Департамента: Рузия Камарова Исламқызы
Департамент анализа и мониторинга религиозной ситуации
Систематическое отслеживание, выявление и анализ основных проблем и тенденций развития религиозной ситуации в Казахстане и мире.
Директор Департамента: Жакиянов Талғат Жардемкулович
Управление музея мира и согласия
Обеспечение функционирования Управления музея, а так же научно-аналитическое и информационно-имиджевое продвижение внутри страны и за рубежом, созидательно-творческих идей и инициатив Первого Президента РК и Президента РК в области установления мира и межконфессионального согласия.
Департамент религиоведческой экспертизы
Организация и проведение религиоведческой экспертизы; определение принадлежности содержания объекта религиоведческой экспертизы к конкретному вероучению, исследование на предмет соблюдения аксиологической нейтральности содержания исследуемого объекта, также оценка вероятности негативного влияния религиозных взглядов и культовой практики на последователей учения и других членов общества.
Директор Департамента: Бірәлі Эльмира Атиголлакызы
Сводно-аналитический департамент
Основными задачами Департамента являются: разработка концептуальных основ и практических рекомендаций на актуальные темы в сфере религии и государственно-конфессиональных отношений.
Директор Департамента: Келесов Мейірман Муратович